Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ssh3Q8K330 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ssh3Q8K330 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms