Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

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Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Abcf3Q8K268 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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