Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Nhlrc3Q8CCH2 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Nhlrc3Q8CCH2 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Nhlrc3Q8CCH2 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Nhlrc3Q8CCH2 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Nhlrc3Q8CCH2 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
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Nhlrc3Q8CCH2 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
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