Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc113Q8C5T8 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms