Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5L3

Cnot2, CCR4-NOT transcription complex subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot2Q8C5L3 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnot2Q8C5L3 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnot2Q8C5L3 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnot2Q8C5L3 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnot2Q8C5L3 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnot2Q8C5L3 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnot2Q8C5L3 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnot2Q8C5L3 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnot2Q8C5L3 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnot2Q8C5L3 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cnot2Q8C5L3 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Cnot2Q8C5L3 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Cnot2Q8C5L3 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Cnot2Q8C5L3 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Cnot2Q8C5L3 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Cnot2Q8C5L3 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnot2Q8C5L3 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnot2Q8C5L3 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnot2Q8C5L3 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnot2Q8C5L3 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnot2Q8C5L3 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnot2Q8C5L3 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnot2Q8C5L3 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnot2Q8C5L3 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnot2Q8C5L3 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnot2Q8C5L3 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnot2Q8C5L3 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnot2Q8C5L3 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnot2Q8C5L3 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnot2Q8C5L3 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnot2Q8C5L3 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnot2Q8C5L3 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnot2Q8C5L3 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnot2Q8C5L3 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnot2Q8C5L3 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnot2Q8C5L3 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnot2Q8C5L3 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnot2Q8C5L3 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnot2Q8C5L3 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnot2Q8C5L3 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnot2Q8C5L3 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnot2Q8C5L3 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnot2Q8C5L3 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnot2Q8C5L3 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnot2Q8C5L3 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnot2Q8C5L3 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnot2Q8C5L3 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnot2Q8C5L3 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnot2Q8C5L3 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnot2Q8C5L3 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnot2Q8C5L3 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnot2Q8C5L3 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnot2Q8C5L3 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnot2Q8C5L3 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnot2Q8C5L3 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnot2Q8C5L3 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnot2Q8C5L3 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnot2Q8C5L3 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnot2Q8C5L3 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnot2Q8C5L3 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnot2Q8C5L3 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnot2Q8C5L3 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnot2Q8C5L3 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnot2Q8C5L3 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnot2Q8C5L3 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnot2Q8C5L3 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnot2Q8C5L3 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnot2Q8C5L3 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnot2Q8C5L3 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnot2Q8C5L3 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnot2Q8C5L3 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnot2Q8C5L3 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnot2Q8C5L3 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnot2Q8C5L3 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnot2Q8C5L3 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnot2Q8C5L3 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnot2Q8C5L3 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnot2Q8C5L3 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnot2Q8C5L3 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnot2Q8C5L3 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnot2Q8C5L3 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnot2Q8C5L3 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnot2Q8C5L3 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnot2Q8C5L3 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnot2Q8C5L3 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnot2Q8C5L3 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnot2Q8C5L3 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnot2Q8C5L3 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnot2Q8C5L3 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnot2Q8C5L3 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnot2Q8C5L3 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnot2Q8C5L3 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cnot2Q8C5L3 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cnot2Q8C5L3 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cnot2Q8C5L3 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cnot2Q8C5L3 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cnot2Q8C5L3 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cnot2Q8C5L3 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cnot2Q8C5L3 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cnot2Q8C5L3 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms