Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2B3

Hdac7, Histone deacetylase 7, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac7Q8C2B3 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hdac7Q8C2B3 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hdac7Q8C2B3 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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