Protein–RNA interactions for Protein: Q8BZW8

Nhlrc2, NHL repeat-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc2Q8BZW8 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nhlrc2Q8BZW8 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nhlrc2Q8BZW8 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Nhlrc2Q8BZW8 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nhlrc2Q8BZW8 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nhlrc2Q8BZW8 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nhlrc2Q8BZW8 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nhlrc2Q8BZW8 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nhlrc2Q8BZW8 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nhlrc2Q8BZW8 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nhlrc2Q8BZW8 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nhlrc2Q8BZW8 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nhlrc2Q8BZW8 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nhlrc2Q8BZW8 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nhlrc2Q8BZW8 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nhlrc2Q8BZW8 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nhlrc2Q8BZW8 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nhlrc2Q8BZW8 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nhlrc2Q8BZW8 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nhlrc2Q8BZW8 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nhlrc2Q8BZW8 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nhlrc2Q8BZW8 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nhlrc2Q8BZW8 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Nhlrc2Q8BZW8 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nhlrc2Q8BZW8 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nhlrc2Q8BZW8 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Nhlrc2Q8BZW8 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nhlrc2Q8BZW8 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nhlrc2Q8BZW8 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nhlrc2Q8BZW8 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nhlrc2Q8BZW8 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nhlrc2Q8BZW8 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nhlrc2Q8BZW8 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nhlrc2Q8BZW8 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nhlrc2Q8BZW8 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nhlrc2Q8BZW8 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nhlrc2Q8BZW8 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nhlrc2Q8BZW8 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Nhlrc2Q8BZW8 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nhlrc2Q8BZW8 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nhlrc2Q8BZW8 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nhlrc2Q8BZW8 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nhlrc2Q8BZW8 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Nhlrc2Q8BZW8 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nhlrc2Q8BZW8 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nhlrc2Q8BZW8 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Nhlrc2Q8BZW8 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nhlrc2Q8BZW8 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Nhlrc2Q8BZW8 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nhlrc2Q8BZW8 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nhlrc2Q8BZW8 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nhlrc2Q8BZW8 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nhlrc2Q8BZW8 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nhlrc2Q8BZW8 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nhlrc2Q8BZW8 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nhlrc2Q8BZW8 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nhlrc2Q8BZW8 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nhlrc2Q8BZW8 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nhlrc2Q8BZW8 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Nhlrc2Q8BZW8 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Nhlrc2Q8BZW8 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nhlrc2Q8BZW8 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nhlrc2Q8BZW8 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Nhlrc2Q8BZW8 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nhlrc2Q8BZW8 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nhlrc2Q8BZW8 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nhlrc2Q8BZW8 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Nhlrc2Q8BZW8 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Nhlrc2Q8BZW8 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Nhlrc2Q8BZW8 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Nhlrc2Q8BZW8 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Nhlrc2Q8BZW8 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Nhlrc2Q8BZW8 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Nhlrc2Q8BZW8 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
Nhlrc2Q8BZW8 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Nhlrc2Q8BZW8 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Nhlrc2Q8BZW8 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Nhlrc2Q8BZW8 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nhlrc2Q8BZW8 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nhlrc2Q8BZW8 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nhlrc2Q8BZW8 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Nhlrc2Q8BZW8 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nhlrc2Q8BZW8 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nhlrc2Q8BZW8 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nhlrc2Q8BZW8 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nhlrc2Q8BZW8 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Nhlrc2Q8BZW8 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nhlrc2Q8BZW8 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nhlrc2Q8BZW8 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nhlrc2Q8BZW8 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Nhlrc2Q8BZW8 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Nhlrc2Q8BZW8 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Nhlrc2Q8BZW8 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nhlrc2Q8BZW8 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nhlrc2Q8BZW8 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nhlrc2Q8BZW8 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nhlrc2Q8BZW8 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nhlrc2Q8BZW8 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nhlrc2Q8BZW8 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nhlrc2Q8BZW8 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms