Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx17Q8BVL3 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
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