Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMQ2

Gtf3c4, General transcription factor 3C polypeptide 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c4Q8BMQ2 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms