Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
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