Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H2-M10.4Q85ZW8 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms