Protein–RNA interactions for Protein: Q80VR2

Ell3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell3Q80VR2 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ell3Q80VR2 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ell3Q80VR2 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.4 ms