Protein–RNA interactions for Protein: Q80UG8

Ttll4, Tubulin polyglutamylase TTLL4, mousemouse

Predictions only

Length 1,193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll4Q80UG8 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttll4Q80UG8 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttll4Q80UG8 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttll4Q80UG8 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttll4Q80UG8 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttll4Q80UG8 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttll4Q80UG8 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttll4Q80UG8 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttll4Q80UG8 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttll4Q80UG8 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttll4Q80UG8 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttll4Q80UG8 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttll4Q80UG8 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttll4Q80UG8 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttll4Q80UG8 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll4Q80UG8 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll4Q80UG8 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll4Q80UG8 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll4Q80UG8 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll4Q80UG8 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll4Q80UG8 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll4Q80UG8 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll4Q80UG8 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll4Q80UG8 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll4Q80UG8 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll4Q80UG8 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll4Q80UG8 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll4Q80UG8 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll4Q80UG8 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll4Q80UG8 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll4Q80UG8 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll4Q80UG8 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll4Q80UG8 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll4Q80UG8 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll4Q80UG8 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll4Q80UG8 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll4Q80UG8 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll4Q80UG8 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll4Q80UG8 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll4Q80UG8 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll4Q80UG8 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll4Q80UG8 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll4Q80UG8 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll4Q80UG8 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll4Q80UG8 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll4Q80UG8 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll4Q80UG8 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll4Q80UG8 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll4Q80UG8 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll4Q80UG8 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll4Q80UG8 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll4Q80UG8 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll4Q80UG8 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll4Q80UG8 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll4Q80UG8 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll4Q80UG8 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll4Q80UG8 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttll4Q80UG8 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttll4Q80UG8 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttll4Q80UG8 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttll4Q80UG8 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttll4Q80UG8 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttll4Q80UG8 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttll4Q80UG8 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttll4Q80UG8 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttll4Q80UG8 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttll4Q80UG8 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttll4Q80UG8 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttll4Q80UG8 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttll4Q80UG8 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttll4Q80UG8 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttll4Q80UG8 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttll4Q80UG8 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttll4Q80UG8 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttll4Q80UG8 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttll4Q80UG8 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttll4Q80UG8 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttll4Q80UG8 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttll4Q80UG8 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttll4Q80UG8 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttll4Q80UG8 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttll4Q80UG8 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttll4Q80UG8 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttll4Q80UG8 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttll4Q80UG8 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttll4Q80UG8 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ttll4Q80UG8 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ttll4Q80UG8 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttll4Q80UG8 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttll4Q80UG8 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttll4Q80UG8 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttll4Q80UG8 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttll4Q80UG8 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttll4Q80UG8 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttll4Q80UG8 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttll4Q80UG8 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttll4Q80UG8 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttll4Q80UG8 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttll4Q80UG8 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttll4Q80UG8 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms