Protein–RNA interactions for Protein: Q80U95

Ube3c, Ubiquitin-protein ligase E3C, mousemouse

Predictions only

Length 1,083 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3cQ80U95 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube3cQ80U95 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube3cQ80U95 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms