Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NischQ80TM9 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NischQ80TM9 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NischQ80TM9 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NischQ80TM9 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NischQ80TM9 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
NischQ80TM9 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NischQ80TM9 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
NischQ80TM9 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
NischQ80TM9 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NischQ80TM9 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NischQ80TM9 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NischQ80TM9 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NischQ80TM9 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NischQ80TM9 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NischQ80TM9 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NischQ80TM9 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NischQ80TM9 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NischQ80TM9 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NischQ80TM9 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NischQ80TM9 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NischQ80TM9 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NischQ80TM9 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NischQ80TM9 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NischQ80TM9 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NischQ80TM9 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NischQ80TM9 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NischQ80TM9 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
NischQ80TM9 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NischQ80TM9 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NischQ80TM9 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NischQ80TM9 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NischQ80TM9 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NischQ80TM9 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NischQ80TM9 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NischQ80TM9 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NischQ80TM9 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NischQ80TM9 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
NischQ80TM9 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NischQ80TM9 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NischQ80TM9 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NischQ80TM9 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NischQ80TM9 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NischQ80TM9 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NischQ80TM9 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NischQ80TM9 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
NischQ80TM9 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NischQ80TM9 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
NischQ80TM9 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
NischQ80TM9 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
NischQ80TM9 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NischQ80TM9 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NischQ80TM9 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NischQ80TM9 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NischQ80TM9 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NischQ80TM9 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NischQ80TM9 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NischQ80TM9 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NischQ80TM9 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NischQ80TM9 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NischQ80TM9 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NischQ80TM9 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NischQ80TM9 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NischQ80TM9 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NischQ80TM9 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NischQ80TM9 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
NischQ80TM9 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NischQ80TM9 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
NischQ80TM9 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NischQ80TM9 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NischQ80TM9 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NischQ80TM9 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NischQ80TM9 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NischQ80TM9 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NischQ80TM9 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NischQ80TM9 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NischQ80TM9 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NischQ80TM9 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NischQ80TM9 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
NischQ80TM9 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NischQ80TM9 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NischQ80TM9 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NischQ80TM9 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NischQ80TM9 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NischQ80TM9 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NischQ80TM9 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NischQ80TM9 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NischQ80TM9 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NischQ80TM9 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NischQ80TM9 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NischQ80TM9 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NischQ80TM9 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NischQ80TM9 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NischQ80TM9 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NischQ80TM9 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
NischQ80TM9 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NischQ80TM9 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NischQ80TM9 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
NischQ80TM9 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NischQ80TM9 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
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