Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

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Length 569 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Shq1Q7TMX5 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Shq1Q7TMX5 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Shq1Q7TMX5 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Shq1Q7TMX5 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Shq1Q7TMX5 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Shq1Q7TMX5 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Shq1Q7TMX5 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Shq1Q7TMX5 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Shq1Q7TMX5 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Shq1Q7TMX5 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Shq1Q7TMX5 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Shq1Q7TMX5 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Shq1Q7TMX5 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Shq1Q7TMX5 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Shq1Q7TMX5 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Shq1Q7TMX5 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Shq1Q7TMX5 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Shq1Q7TMX5 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Shq1Q7TMX5 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Shq1Q7TMX5 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Shq1Q7TMX5 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Shq1Q7TMX5 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Shq1Q7TMX5 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Shq1Q7TMX5 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Shq1Q7TMX5 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Shq1Q7TMX5 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
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Shq1Q7TMX5 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Shq1Q7TMX5 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Shq1Q7TMX5 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Shq1Q7TMX5 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Shq1Q7TMX5 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Shq1Q7TMX5 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Shq1Q7TMX5 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Shq1Q7TMX5 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Shq1Q7TMX5 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Shq1Q7TMX5 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Shq1Q7TMX5 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Shq1Q7TMX5 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Shq1Q7TMX5 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Shq1Q7TMX5 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Shq1Q7TMX5 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Shq1Q7TMX5 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Shq1Q7TMX5 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Shq1Q7TMX5 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Shq1Q7TMX5 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Shq1Q7TMX5 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Shq1Q7TMX5 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Shq1Q7TMX5 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Shq1Q7TMX5 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Shq1Q7TMX5 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Shq1Q7TMX5 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Shq1Q7TMX5 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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Shq1Q7TMX5 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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Shq1Q7TMX5 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Shq1Q7TMX5 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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Shq1Q7TMX5 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Shq1Q7TMX5 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Shq1Q7TMX5 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Shq1Q7TMX5 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Shq1Q7TMX5 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Shq1Q7TMX5 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Shq1Q7TMX5 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Shq1Q7TMX5 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Shq1Q7TMX5 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Shq1Q7TMX5 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Shq1Q7TMX5 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Shq1Q7TMX5 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Shq1Q7TMX5 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Shq1Q7TMX5 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Shq1Q7TMX5 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Shq1Q7TMX5 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Shq1Q7TMX5 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Shq1Q7TMX5 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Shq1Q7TMX5 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Shq1Q7TMX5 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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