Protein–RNA interactions for Protein: Q78RX3

Smim12, Small integral membrane protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim12Q78RX3 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim12Q78RX3 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim12Q78RX3 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim12Q78RX3 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim12Q78RX3 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim12Q78RX3 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim12Q78RX3 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim12Q78RX3 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim12Q78RX3 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim12Q78RX3 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim12Q78RX3 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim12Q78RX3 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim12Q78RX3 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim12Q78RX3 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim12Q78RX3 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim12Q78RX3 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim12Q78RX3 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim12Q78RX3 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim12Q78RX3 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim12Q78RX3 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim12Q78RX3 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim12Q78RX3 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim12Q78RX3 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim12Q78RX3 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim12Q78RX3 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim12Q78RX3 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim12Q78RX3 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim12Q78RX3 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim12Q78RX3 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim12Q78RX3 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim12Q78RX3 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim12Q78RX3 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim12Q78RX3 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim12Q78RX3 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim12Q78RX3 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim12Q78RX3 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim12Q78RX3 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim12Q78RX3 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim12Q78RX3 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim12Q78RX3 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim12Q78RX3 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim12Q78RX3 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim12Q78RX3 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim12Q78RX3 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim12Q78RX3 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim12Q78RX3 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim12Q78RX3 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim12Q78RX3 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim12Q78RX3 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim12Q78RX3 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim12Q78RX3 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim12Q78RX3 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim12Q78RX3 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim12Q78RX3 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim12Q78RX3 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim12Q78RX3 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim12Q78RX3 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim12Q78RX3 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim12Q78RX3 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim12Q78RX3 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim12Q78RX3 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim12Q78RX3 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim12Q78RX3 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim12Q78RX3 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim12Q78RX3 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim12Q78RX3 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim12Q78RX3 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim12Q78RX3 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim12Q78RX3 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim12Q78RX3 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim12Q78RX3 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim12Q78RX3 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim12Q78RX3 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim12Q78RX3 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim12Q78RX3 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim12Q78RX3 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim12Q78RX3 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim12Q78RX3 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim12Q78RX3 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim12Q78RX3 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim12Q78RX3 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim12Q78RX3 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim12Q78RX3 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim12Q78RX3 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim12Q78RX3 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim12Q78RX3 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim12Q78RX3 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim12Q78RX3 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim12Q78RX3 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim12Q78RX3 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim12Q78RX3 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim12Q78RX3 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim12Q78RX3 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim12Q78RX3 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim12Q78RX3 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim12Q78RX3 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim12Q78RX3 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim12Q78RX3 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim12Q78RX3 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim12Q78RX3 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 204 ms