Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPI3

Lcor, Ligand-dependent corepressor, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorQ6ZPI3 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
LcorQ6ZPI3 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
LcorQ6ZPI3 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
LcorQ6ZPI3 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
LcorQ6ZPI3 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
LcorQ6ZPI3 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
LcorQ6ZPI3 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
LcorQ6ZPI3 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
LcorQ6ZPI3 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
LcorQ6ZPI3 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
LcorQ6ZPI3 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
LcorQ6ZPI3 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
LcorQ6ZPI3 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LcorQ6ZPI3 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
LcorQ6ZPI3 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LcorQ6ZPI3 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
LcorQ6ZPI3 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
LcorQ6ZPI3 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
LcorQ6ZPI3 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LcorQ6ZPI3 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LcorQ6ZPI3 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LcorQ6ZPI3 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LcorQ6ZPI3 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LcorQ6ZPI3 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
LcorQ6ZPI3 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LcorQ6ZPI3 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LcorQ6ZPI3 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LcorQ6ZPI3 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LcorQ6ZPI3 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LcorQ6ZPI3 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LcorQ6ZPI3 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LcorQ6ZPI3 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
LcorQ6ZPI3 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
LcorQ6ZPI3 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LcorQ6ZPI3 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LcorQ6ZPI3 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
LcorQ6ZPI3 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
LcorQ6ZPI3 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
LcorQ6ZPI3 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
LcorQ6ZPI3 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LcorQ6ZPI3 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LcorQ6ZPI3 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LcorQ6ZPI3 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
LcorQ6ZPI3 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LcorQ6ZPI3 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LcorQ6ZPI3 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
LcorQ6ZPI3 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LcorQ6ZPI3 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LcorQ6ZPI3 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LcorQ6ZPI3 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
LcorQ6ZPI3 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
LcorQ6ZPI3 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LcorQ6ZPI3 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LcorQ6ZPI3 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
LcorQ6ZPI3 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LcorQ6ZPI3 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
LcorQ6ZPI3 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LcorQ6ZPI3 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LcorQ6ZPI3 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LcorQ6ZPI3 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LcorQ6ZPI3 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LcorQ6ZPI3 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LcorQ6ZPI3 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LcorQ6ZPI3 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LcorQ6ZPI3 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
LcorQ6ZPI3 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LcorQ6ZPI3 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LcorQ6ZPI3 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LcorQ6ZPI3 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LcorQ6ZPI3 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LcorQ6ZPI3 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LcorQ6ZPI3 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LcorQ6ZPI3 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LcorQ6ZPI3 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
LcorQ6ZPI3 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LcorQ6ZPI3 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LcorQ6ZPI3 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LcorQ6ZPI3 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LcorQ6ZPI3 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
LcorQ6ZPI3 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LcorQ6ZPI3 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LcorQ6ZPI3 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LcorQ6ZPI3 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
LcorQ6ZPI3 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
LcorQ6ZPI3 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LcorQ6ZPI3 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LcorQ6ZPI3 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LcorQ6ZPI3 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LcorQ6ZPI3 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LcorQ6ZPI3 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LcorQ6ZPI3 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LcorQ6ZPI3 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LcorQ6ZPI3 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LcorQ6ZPI3 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
LcorQ6ZPI3 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
LcorQ6ZPI3 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LcorQ6ZPI3 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LcorQ6ZPI3 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LcorQ6ZPI3 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LcorQ6ZPI3 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.6 ms