Protein–RNA interactions for Protein: Q6RT24

Cenpe, Centromere-associated protein E, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpeQ6RT24 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CenpeQ6RT24 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CenpeQ6RT24 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
CenpeQ6RT24 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CenpeQ6RT24 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
CenpeQ6RT24 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
CenpeQ6RT24 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
CenpeQ6RT24 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
CenpeQ6RT24 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
CenpeQ6RT24 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
CenpeQ6RT24 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
CenpeQ6RT24 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
CenpeQ6RT24 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
CenpeQ6RT24 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
CenpeQ6RT24 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CenpeQ6RT24 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CenpeQ6RT24 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CenpeQ6RT24 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
CenpeQ6RT24 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CenpeQ6RT24 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CenpeQ6RT24 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CenpeQ6RT24 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CenpeQ6RT24 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CenpeQ6RT24 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CenpeQ6RT24 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CenpeQ6RT24 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CenpeQ6RT24 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CenpeQ6RT24 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CenpeQ6RT24 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CenpeQ6RT24 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CenpeQ6RT24 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CenpeQ6RT24 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CenpeQ6RT24 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
CenpeQ6RT24 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CenpeQ6RT24 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CenpeQ6RT24 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CenpeQ6RT24 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CenpeQ6RT24 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CenpeQ6RT24 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CenpeQ6RT24 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CenpeQ6RT24 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CenpeQ6RT24 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CenpeQ6RT24 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CenpeQ6RT24 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CenpeQ6RT24 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
CenpeQ6RT24 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
CenpeQ6RT24 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
CenpeQ6RT24 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
CenpeQ6RT24 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
CenpeQ6RT24 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CenpeQ6RT24 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
CenpeQ6RT24 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CenpeQ6RT24 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CenpeQ6RT24 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CenpeQ6RT24 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CenpeQ6RT24 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CenpeQ6RT24 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CenpeQ6RT24 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CenpeQ6RT24 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CenpeQ6RT24 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CenpeQ6RT24 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CenpeQ6RT24 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CenpeQ6RT24 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CenpeQ6RT24 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CenpeQ6RT24 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CenpeQ6RT24 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CenpeQ6RT24 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CenpeQ6RT24 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CenpeQ6RT24 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CenpeQ6RT24 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
CenpeQ6RT24 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CenpeQ6RT24 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
CenpeQ6RT24 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
CenpeQ6RT24 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
CenpeQ6RT24 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CenpeQ6RT24 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CenpeQ6RT24 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CenpeQ6RT24 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CenpeQ6RT24 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CenpeQ6RT24 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CenpeQ6RT24 Drg1-201ENSMUST00000020741 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CenpeQ6RT24 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CenpeQ6RT24 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CenpeQ6RT24 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
CenpeQ6RT24 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
CenpeQ6RT24 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CenpeQ6RT24 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
CenpeQ6RT24 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CenpeQ6RT24 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CenpeQ6RT24 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CenpeQ6RT24 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CenpeQ6RT24 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CenpeQ6RT24 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CenpeQ6RT24 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CenpeQ6RT24 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CenpeQ6RT24 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CenpeQ6RT24 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CenpeQ6RT24 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CenpeQ6RT24 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CenpeQ6RT24 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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