Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CtifQ6PEE2 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CtifQ6PEE2 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CtifQ6PEE2 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CtifQ6PEE2 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CtifQ6PEE2 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CtifQ6PEE2 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CtifQ6PEE2 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CtifQ6PEE2 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CtifQ6PEE2 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CtifQ6PEE2 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CtifQ6PEE2 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CtifQ6PEE2 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CtifQ6PEE2 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CtifQ6PEE2 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CtifQ6PEE2 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CtifQ6PEE2 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CtifQ6PEE2 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CtifQ6PEE2 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CtifQ6PEE2 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CtifQ6PEE2 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CtifQ6PEE2 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CtifQ6PEE2 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CtifQ6PEE2 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CtifQ6PEE2 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CtifQ6PEE2 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CtifQ6PEE2 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CtifQ6PEE2 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CtifQ6PEE2 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CtifQ6PEE2 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CtifQ6PEE2 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CtifQ6PEE2 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CtifQ6PEE2 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CtifQ6PEE2 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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