Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tpm4Q6IRU2 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88 ms