Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX4

Krt39, Keratin, type I cytoskeletal 39, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt39Q6IFX4 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt39Q6IFX4 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt39Q6IFX4 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt39Q6IFX4 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt39Q6IFX4 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt39Q6IFX4 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt39Q6IFX4 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt39Q6IFX4 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt39Q6IFX4 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt39Q6IFX4 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt39Q6IFX4 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt39Q6IFX4 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt39Q6IFX4 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt39Q6IFX4 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt39Q6IFX4 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt39Q6IFX4 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt39Q6IFX4 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt39Q6IFX4 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt39Q6IFX4 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt39Q6IFX4 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt39Q6IFX4 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt39Q6IFX4 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt39Q6IFX4 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt39Q6IFX4 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt39Q6IFX4 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt39Q6IFX4 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt39Q6IFX4 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt39Q6IFX4 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt39Q6IFX4 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt39Q6IFX4 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt39Q6IFX4 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt39Q6IFX4 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt39Q6IFX4 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt39Q6IFX4 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt39Q6IFX4 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt39Q6IFX4 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt39Q6IFX4 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Krt39Q6IFX4 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt39Q6IFX4 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt39Q6IFX4 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt39Q6IFX4 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt39Q6IFX4 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt39Q6IFX4 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt39Q6IFX4 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt39Q6IFX4 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt39Q6IFX4 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt39Q6IFX4 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt39Q6IFX4 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt39Q6IFX4 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt39Q6IFX4 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt39Q6IFX4 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt39Q6IFX4 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt39Q6IFX4 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt39Q6IFX4 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt39Q6IFX4 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt39Q6IFX4 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt39Q6IFX4 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt39Q6IFX4 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt39Q6IFX4 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt39Q6IFX4 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt39Q6IFX4 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt39Q6IFX4 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt39Q6IFX4 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt39Q6IFX4 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt39Q6IFX4 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt39Q6IFX4 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt39Q6IFX4 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt39Q6IFX4 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Krt39Q6IFX4 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt39Q6IFX4 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt39Q6IFX4 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt39Q6IFX4 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt39Q6IFX4 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt39Q6IFX4 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt39Q6IFX4 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt39Q6IFX4 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt39Q6IFX4 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt39Q6IFX4 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt39Q6IFX4 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt39Q6IFX4 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt39Q6IFX4 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt39Q6IFX4 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt39Q6IFX4 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt39Q6IFX4 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt39Q6IFX4 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt39Q6IFX4 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt39Q6IFX4 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt39Q6IFX4 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt39Q6IFX4 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt39Q6IFX4 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt39Q6IFX4 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt39Q6IFX4 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt39Q6IFX4 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt39Q6IFX4 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt39Q6IFX4 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt39Q6IFX4 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt39Q6IFX4 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt39Q6IFX4 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt39Q6IFX4 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt39Q6IFX4 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms