Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC6

Tro, Tro protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,087 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TroQ6DIC6 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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TroQ6DIC6 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
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TroQ6DIC6 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
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TroQ6DIC6 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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TroQ6DIC6 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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TroQ6DIC6 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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TroQ6DIC6 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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TroQ6DIC6 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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TroQ6DIC6 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TroQ6DIC6 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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