Protein–RNA interactions for Protein: Q64310

Surf4, Surfeit locus protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf4Q64310 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Surf4Q64310 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Surf4Q64310 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Surf4Q64310 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Surf4Q64310 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Surf4Q64310 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Surf4Q64310 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Surf4Q64310 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Surf4Q64310 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Surf4Q64310 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Surf4Q64310 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Surf4Q64310 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Surf4Q64310 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Surf4Q64310 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Surf4Q64310 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Surf4Q64310 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Surf4Q64310 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Surf4Q64310 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Surf4Q64310 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Surf4Q64310 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Surf4Q64310 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Surf4Q64310 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Surf4Q64310 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Surf4Q64310 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Surf4Q64310 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Surf4Q64310 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Surf4Q64310 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Surf4Q64310 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Surf4Q64310 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Surf4Q64310 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Surf4Q64310 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms