Protein–RNA interactions for Protein: Q64016

Defa17, Alpha-defensin 17 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 82 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa17Q64016 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Defa17Q64016 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Defa17Q64016 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Defa17Q64016 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Defa17Q64016 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Defa17Q64016 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Defa17Q64016 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Defa17Q64016 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Defa17Q64016 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Defa17Q64016 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Defa17Q64016 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Defa17Q64016 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Defa17Q64016 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Defa17Q64016 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Defa17Q64016 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Defa17Q64016 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Defa17Q64016 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Defa17Q64016 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Defa17Q64016 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Defa17Q64016 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Defa17Q64016 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Defa17Q64016 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Defa17Q64016 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Defa17Q64016 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Defa17Q64016 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Defa17Q64016 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Defa17Q64016 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Defa17Q64016 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Defa17Q64016 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Defa17Q64016 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Defa17Q64016 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Defa17Q64016 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Defa17Q64016 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Defa17Q64016 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Defa17Q64016 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Defa17Q64016 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Defa17Q64016 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Defa17Q64016 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Defa17Q64016 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Defa17Q64016 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Defa17Q64016 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Defa17Q64016 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Defa17Q64016 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Defa17Q64016 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Defa17Q64016 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Defa17Q64016 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Defa17Q64016 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Defa17Q64016 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Defa17Q64016 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Defa17Q64016 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Defa17Q64016 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Defa17Q64016 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Defa17Q64016 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Defa17Q64016 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Defa17Q64016 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Defa17Q64016 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Defa17Q64016 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Defa17Q64016 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa17Q64016 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa17Q64016 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Defa17Q64016 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa17Q64016 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa17Q64016 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa17Q64016 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa17Q64016 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa17Q64016 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa17Q64016 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa17Q64016 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa17Q64016 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa17Q64016 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa17Q64016 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa17Q64016 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa17Q64016 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa17Q64016 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
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Defa17Q64016 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa17Q64016 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Defa17Q64016 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa17Q64016 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Defa17Q64016 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms