Protein–RNA interactions for Protein: Q61474

Msi1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi1Q61474 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms