Protein–RNA interactions for Protein: Q61313

Tfap2b, Transcription factor AP-2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2bQ61313 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tfap2bQ61313 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms