Protein–RNA interactions for Protein: Q61282

Acan, Aggrecan core protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AcanQ61282 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
AcanQ61282 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
AcanQ61282 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
AcanQ61282 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
AcanQ61282 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
AcanQ61282 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
AcanQ61282 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
AcanQ61282 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
AcanQ61282 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms