Protein–RNA interactions for Protein: Q60973

Rbbp7, Histone-binding protein RBBP7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp7Q60973 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Rbbp7Q60973 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Rbbp7Q60973 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Rbbp7Q60973 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbbp7Q60973 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms