Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

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Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Traf3Q60803 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 263.3 ms