Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

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Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim58Q5NCC9 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim58Q5NCC9 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim58Q5NCC9 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim58Q5NCC9 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim58Q5NCC9 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim58Q5NCC9 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim58Q5NCC9 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim58Q5NCC9 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim58Q5NCC9 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim58Q5NCC9 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim58Q5NCC9 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim58Q5NCC9 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim58Q5NCC9 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim58Q5NCC9 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim58Q5NCC9 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim58Q5NCC9 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim58Q5NCC9 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim58Q5NCC9 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim58Q5NCC9 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim58Q5NCC9 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim58Q5NCC9 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim58Q5NCC9 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim58Q5NCC9 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim58Q5NCC9 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim58Q5NCC9 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim58Q5NCC9 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim58Q5NCC9 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim58Q5NCC9 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim58Q5NCC9 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim58Q5NCC9 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim58Q5NCC9 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trim58Q5NCC9 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trim58Q5NCC9 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trim58Q5NCC9 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trim58Q5NCC9 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trim58Q5NCC9 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trim58Q5NCC9 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trim58Q5NCC9 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Trim58Q5NCC9 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim58Q5NCC9 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim58Q5NCC9 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Trim58Q5NCC9 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim58Q5NCC9 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim58Q5NCC9 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim58Q5NCC9 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim58Q5NCC9 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim58Q5NCC9 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Trim58Q5NCC9 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim58Q5NCC9 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim58Q5NCC9 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim58Q5NCC9 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim58Q5NCC9 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Trim58Q5NCC9 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Trim58Q5NCC9 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Trim58Q5NCC9 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Trim58Q5NCC9 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Trim58Q5NCC9 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Trim58Q5NCC9 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim58Q5NCC9 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim58Q5NCC9 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim58Q5NCC9 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim58Q5NCC9 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim58Q5NCC9 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim58Q5NCC9 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim58Q5NCC9 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim58Q5NCC9 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim58Q5NCC9 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim58Q5NCC9 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim58Q5NCC9 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim58Q5NCC9 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim58Q5NCC9 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim58Q5NCC9 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim58Q5NCC9 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim58Q5NCC9 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim58Q5NCC9 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim58Q5NCC9 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim58Q5NCC9 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim58Q5NCC9 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim58Q5NCC9 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim58Q5NCC9 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim58Q5NCC9 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim58Q5NCC9 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
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