Protein–RNA interactions for Protein: Q52KE7

Ccnl1, Cyclin-L1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnl1Q52KE7 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms