Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

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Length 621 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
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Ccdc185Q3V118 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Ccdc185Q3V118 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Ccdc185Q3V118 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Ccdc185Q3V118 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc185Q3V118 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Ccdc185Q3V118 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc185Q3V118 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc185Q3V118 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc185Q3V118 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc185Q3V118 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc185Q3V118 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc185Q3V118 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc185Q3V118 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc185Q3V118 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Ccdc185Q3V118 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc185Q3V118 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc185Q3V118 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc185Q3V118 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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