Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXZ9

Kdm5a, Lysine-specific demethylase 5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Kdm5aQ3UXZ9 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kdm5aQ3UXZ9 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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Kdm5aQ3UXZ9 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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Kdm5aQ3UXZ9 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kdm5aQ3UXZ9 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kdm5aQ3UXZ9 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kdm5aQ3UXZ9 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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Kdm5aQ3UXZ9 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
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Kdm5aQ3UXZ9 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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Kdm5aQ3UXZ9 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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Kdm5aQ3UXZ9 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kdm5aQ3UXZ9 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
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Kdm5aQ3UXZ9 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kdm5aQ3UXZ9 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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Kdm5aQ3UXZ9 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kdm5aQ3UXZ9 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kdm5aQ3UXZ9 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kdm5aQ3UXZ9 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kdm5aQ3UXZ9 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kdm5aQ3UXZ9 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kdm5aQ3UXZ9 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
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Kdm5aQ3UXZ9 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Kdm5aQ3UXZ9 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kdm5aQ3UXZ9 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kdm5aQ3UXZ9 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kdm5aQ3UXZ9 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kdm5aQ3UXZ9 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms