Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hdgfl2Q3UMU9 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Hdgfl2Q3UMU9 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hdgfl2Q3UMU9 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms