Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

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Length 985 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc33Q3ULW6 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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