Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
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Nkx6-3Q3UHX8 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
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Nkx6-3Q3UHX8 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
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Nkx6-3Q3UHX8 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
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Nkx6-3Q3UHX8 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
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Nkx6-3Q3UHX8 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
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Nkx6-3Q3UHX8 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
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Nkx6-3Q3UHX8 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
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Nkx6-3Q3UHX8 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nkx6-3Q3UHX8 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
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