Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms