Protein–RNA interactions for Protein: Q3UBG2

Pid1, PTB-containing, cubilin and LRP1-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pid1Q3UBG2 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pid1Q3UBG2 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pid1Q3UBG2 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pid1Q3UBG2 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pid1Q3UBG2 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pid1Q3UBG2 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pid1Q3UBG2 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pid1Q3UBG2 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pid1Q3UBG2 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pid1Q3UBG2 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pid1Q3UBG2 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pid1Q3UBG2 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pid1Q3UBG2 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pid1Q3UBG2 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pid1Q3UBG2 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Pid1Q3UBG2 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pid1Q3UBG2 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Pid1Q3UBG2 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pid1Q3UBG2 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pid1Q3UBG2 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pid1Q3UBG2 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pid1Q3UBG2 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pid1Q3UBG2 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pid1Q3UBG2 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pid1Q3UBG2 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pid1Q3UBG2 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pid1Q3UBG2 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pid1Q3UBG2 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Pid1Q3UBG2 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Pid1Q3UBG2 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pid1Q3UBG2 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pid1Q3UBG2 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pid1Q3UBG2 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pid1Q3UBG2 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pid1Q3UBG2 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pid1Q3UBG2 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Pid1Q3UBG2 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pid1Q3UBG2 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pid1Q3UBG2 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pid1Q3UBG2 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pid1Q3UBG2 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pid1Q3UBG2 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Pid1Q3UBG2 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pid1Q3UBG2 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pid1Q3UBG2 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pid1Q3UBG2 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Pid1Q3UBG2 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Pid1Q3UBG2 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pid1Q3UBG2 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pid1Q3UBG2 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pid1Q3UBG2 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pid1Q3UBG2 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pid1Q3UBG2 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pid1Q3UBG2 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pid1Q3UBG2 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pid1Q3UBG2 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pid1Q3UBG2 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pid1Q3UBG2 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pid1Q3UBG2 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pid1Q3UBG2 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pid1Q3UBG2 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Pid1Q3UBG2 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pid1Q3UBG2 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pid1Q3UBG2 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pid1Q3UBG2 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pid1Q3UBG2 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pid1Q3UBG2 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pid1Q3UBG2 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pid1Q3UBG2 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pid1Q3UBG2 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Pid1Q3UBG2 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Pid1Q3UBG2 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Pid1Q3UBG2 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Pid1Q3UBG2 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pid1Q3UBG2 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pid1Q3UBG2 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pid1Q3UBG2 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pid1Q3UBG2 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pid1Q3UBG2 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pid1Q3UBG2 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pid1Q3UBG2 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pid1Q3UBG2 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pid1Q3UBG2 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pid1Q3UBG2 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pid1Q3UBG2 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pid1Q3UBG2 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pid1Q3UBG2 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pid1Q3UBG2 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pid1Q3UBG2 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pid1Q3UBG2 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pid1Q3UBG2 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pid1Q3UBG2 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pid1Q3UBG2 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pid1Q3UBG2 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pid1Q3UBG2 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pid1Q3UBG2 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pid1Q3UBG2 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pid1Q3UBG2 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pid1Q3UBG2 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pid1Q3UBG2 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms