Protein–RNA interactions for Protein: Q3U9F6

Rnf166, RING finger protein 166, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf166Q3U9F6 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Ccdc7a-201ENSMUST00000095158 1547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 AC153524.2-201ENSMUST00000218351 1375 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Mrps36-203ENSMUST00000109333 701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Gm15443-201ENSMUST00000118947 820 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Gm11850-201ENSMUST00000119679 479 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Gm16618-201ENSMUST00000134992 955 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Olfr1244-ps1-201ENSMUST00000213226 683 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Gm18594-201ENSMUST00000175733 1403 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Gm10375-201ENSMUST00000100692 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Tmsb15l-201ENSMUST00000127404 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Gm12735-201ENSMUST00000146218 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Gm26401-201ENSMUST00000158502 76 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Vmn1r-ps49-201ENSMUST00000177009 879 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Gm27715-201ENSMUST00000184714 260 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Scgb2b31-ps-201ENSMUST00000188734 328 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Scgb2b32-ps-201ENSMUST00000190326 337 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Gm7492-201ENSMUST00000201745 725 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnf166Q3U9F6 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms