Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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Gtpbp6Q3U6U5 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Arl14ep-202ENSMUST00000093883 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
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Gtpbp6Q3U6U5 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28819-202ENSMUST00000187416 1335 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
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Gtpbp6Q3U6U5 Cd55b-202ENSMUST00000119432 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11948-201ENSMUST00000142322 539 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gtpbp6Q3U6U5 Ccl12-201ENSMUST00000000194 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
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Gtpbp6Q3U6U5 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
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Gtpbp6Q3U6U5 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
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Gtpbp6Q3U6U5 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Cep112-202ENSMUST00000106715 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm15929-201ENSMUST00000138926 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 2310031A07Rik-201ENSMUST00000181212 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Gm6140-201ENSMUST00000192494 966 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Gm33501-201ENSMUST00000209257 1193 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gtpbp6Q3U6U5 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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