Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q3U595 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q3U595 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q3U595 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q3U595 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q3U595 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q3U595 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q3U595 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q3U595 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q3U595 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q3U595 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q3U595 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q3U595 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q3U595 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q3U595 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Q3U595 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Q3U595 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q3U595 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q3U595 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Q3U595 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q3U595 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Q3U595 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q3U595 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q3U595 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q3U595 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q3U595 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Q3U595 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Q3U595 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q3U595 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q3U595 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q3U595 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q3U595 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q3U595 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q3U595 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q3U595 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q3U595 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q3U595 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q3U595 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q3U595 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q3U595 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q3U595 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q3U595 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q3U595 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Q3U595 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Q3U595 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q3U595 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q3U595 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q3U595 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q3U595 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q3U595 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q3U595 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q3U595 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q3U595 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q3U595 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q3U595 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q3U595 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q3U595 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q3U595 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q3U595 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q3U595 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q3U595 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Q3U595 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q3U595 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q3U595 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q3U595 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q3U595 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q3U595 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Q3U595 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Q3U595 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q3U595 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Q3U595 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Q3U595 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q3U595 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q3U595 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q3U595 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q3U595 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q3U595 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q3U595 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q3U595 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q3U595 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q3U595 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q3U595 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q3U595 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q3U595 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q3U595 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q3U595 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q3U595 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q3U595 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q3U595 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Q3U595 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U595 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U595 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U595 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U595 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U595 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U595 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U595 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U595 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U595 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Q3U595 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.7 ms