Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
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Usp39Q3TIX9 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Usp39Q3TIX9 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Usp39Q3TIX9 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
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Usp39Q3TIX9 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Usp39Q3TIX9 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Usp39Q3TIX9 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Usp39Q3TIX9 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Usp39Q3TIX9 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Usp39Q3TIX9 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Usp39Q3TIX9 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Usp39Q3TIX9 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Usp39Q3TIX9 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Usp39Q3TIX9 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Usp39Q3TIX9 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Usp39Q3TIX9 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp39Q3TIX9 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
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