Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc13Q3TIR1 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc13Q3TIR1 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc13Q3TIR1 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc13Q3TIR1 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc13Q3TIR1 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc13Q3TIR1 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc13Q3TIR1 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc13Q3TIR1 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc13Q3TIR1 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc13Q3TIR1 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc13Q3TIR1 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc13Q3TIR1 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc13Q3TIR1 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc13Q3TIR1 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc13Q3TIR1 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc13Q3TIR1 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc13Q3TIR1 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc13Q3TIR1 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc13Q3TIR1 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc13Q3TIR1 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc13Q3TIR1 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc13Q3TIR1 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc13Q3TIR1 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc13Q3TIR1 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc13Q3TIR1 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc13Q3TIR1 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc13Q3TIR1 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc13Q3TIR1 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc13Q3TIR1 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc13Q3TIR1 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc13Q3TIR1 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc13Q3TIR1 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc13Q3TIR1 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc13Q3TIR1 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc13Q3TIR1 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc13Q3TIR1 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc13Q3TIR1 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc13Q3TIR1 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc13Q3TIR1 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trappc13Q3TIR1 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trappc13Q3TIR1 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trappc13Q3TIR1 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trappc13Q3TIR1 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trappc13Q3TIR1 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trappc13Q3TIR1 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trappc13Q3TIR1 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trappc13Q3TIR1 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trappc13Q3TIR1 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trappc13Q3TIR1 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trappc13Q3TIR1 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trappc13Q3TIR1 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trappc13Q3TIR1 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trappc13Q3TIR1 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trappc13Q3TIR1 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Trappc13Q3TIR1 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trappc13Q3TIR1 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trappc13Q3TIR1 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Trappc13Q3TIR1 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Trappc13Q3TIR1 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trappc13Q3TIR1 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trappc13Q3TIR1 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trappc13Q3TIR1 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trappc13Q3TIR1 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trappc13Q3TIR1 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trappc13Q3TIR1 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trappc13Q3TIR1 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trappc13Q3TIR1 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trappc13Q3TIR1 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trappc13Q3TIR1 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trappc13Q3TIR1 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trappc13Q3TIR1 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trappc13Q3TIR1 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trappc13Q3TIR1 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trappc13Q3TIR1 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trappc13Q3TIR1 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trappc13Q3TIR1 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trappc13Q3TIR1 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc13Q3TIR1 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc13Q3TIR1 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc13Q3TIR1 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc13Q3TIR1 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc13Q3TIR1 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc13Q3TIR1 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc13Q3TIR1 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc13Q3TIR1 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc13Q3TIR1 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc13Q3TIR1 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc13Q3TIR1 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc13Q3TIR1 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc13Q3TIR1 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc13Q3TIR1 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc13Q3TIR1 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc13Q3TIR1 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc13Q3TIR1 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc13Q3TIR1 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc13Q3TIR1 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc13Q3TIR1 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc13Q3TIR1 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc13Q3TIR1 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms