Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ttc39dQ0VF76 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ttc39dQ0VF76 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Ttc39dQ0VF76 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Ttc39dQ0VF76 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Ttc39dQ0VF76 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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