Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Itgb8Q0VBD0 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms