Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab42Q0PD08 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms