Protein–RNA interactions for Protein: Q0MW30

Neurl1b, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, mousemouse

Predictions only

Length 546 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl1bQ0MW30 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Neurl1bQ0MW30 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Neurl1bQ0MW30 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Neurl1bQ0MW30 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Neurl1bQ0MW30 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Neurl1bQ0MW30 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Neurl1bQ0MW30 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Neurl1bQ0MW30 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Neurl1bQ0MW30 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Neurl1bQ0MW30 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Neurl1bQ0MW30 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Neurl1bQ0MW30 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Neurl1bQ0MW30 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Neurl1bQ0MW30 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Neurl1bQ0MW30 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Neurl1bQ0MW30 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Neurl1bQ0MW30 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Neurl1bQ0MW30 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Neurl1bQ0MW30 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Neurl1bQ0MW30 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Neurl1bQ0MW30 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Neurl1bQ0MW30 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Neurl1bQ0MW30 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Neurl1bQ0MW30 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Neurl1bQ0MW30 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Neurl1bQ0MW30 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Neurl1bQ0MW30 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Neurl1bQ0MW30 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Neurl1bQ0MW30 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Neurl1bQ0MW30 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Neurl1bQ0MW30 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Neurl1bQ0MW30 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Neurl1bQ0MW30 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Neurl1bQ0MW30 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Neurl1bQ0MW30 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Neurl1bQ0MW30 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Neurl1bQ0MW30 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Neurl1bQ0MW30 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Neurl1bQ0MW30 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Neurl1bQ0MW30 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Neurl1bQ0MW30 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Neurl1bQ0MW30 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Neurl1bQ0MW30 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Neurl1bQ0MW30 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Neurl1bQ0MW30 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Neurl1bQ0MW30 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Neurl1bQ0MW30 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Neurl1bQ0MW30 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Neurl1bQ0MW30 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Neurl1bQ0MW30 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Neurl1bQ0MW30 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Neurl1bQ0MW30 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Neurl1bQ0MW30 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Neurl1bQ0MW30 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Neurl1bQ0MW30 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Neurl1bQ0MW30 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Neurl1bQ0MW30 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Neurl1bQ0MW30 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Neurl1bQ0MW30 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Neurl1bQ0MW30 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Neurl1bQ0MW30 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Neurl1bQ0MW30 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Neurl1bQ0MW30 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Neurl1bQ0MW30 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Neurl1bQ0MW30 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Neurl1bQ0MW30 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Neurl1bQ0MW30 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Neurl1bQ0MW30 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Neurl1bQ0MW30 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Neurl1bQ0MW30 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Neurl1bQ0MW30 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Neurl1bQ0MW30 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Neurl1bQ0MW30 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Neurl1bQ0MW30 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Neurl1bQ0MW30 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Neurl1bQ0MW30 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Neurl1bQ0MW30 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Neurl1bQ0MW30 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Neurl1bQ0MW30 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Neurl1bQ0MW30 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Neurl1bQ0MW30 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Neurl1bQ0MW30 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Neurl1bQ0MW30 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Neurl1bQ0MW30 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Neurl1bQ0MW30 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Neurl1bQ0MW30 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Neurl1bQ0MW30 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Neurl1bQ0MW30 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Neurl1bQ0MW30 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Neurl1bQ0MW30 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Neurl1bQ0MW30 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Neurl1bQ0MW30 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Neurl1bQ0MW30 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Neurl1bQ0MW30 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Neurl1bQ0MW30 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Neurl1bQ0MW30 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Neurl1bQ0MW30 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Neurl1bQ0MW30 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Neurl1bQ0MW30 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Neurl1bQ0MW30 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms