Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tgm3Q08189 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms