Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
MestQ07646 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
MestQ07646 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
MestQ07646 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
MestQ07646 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
MestQ07646 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
MestQ07646 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
MestQ07646 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
MestQ07646 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
MestQ07646 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
MestQ07646 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
MestQ07646 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
MestQ07646 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
MestQ07646 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
MestQ07646 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
MestQ07646 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
MestQ07646 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
MestQ07646 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
MestQ07646 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
MestQ07646 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
MestQ07646 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
MestQ07646 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
MestQ07646 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
MestQ07646 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
MestQ07646 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
MestQ07646 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
MestQ07646 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
MestQ07646 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
MestQ07646 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
MestQ07646 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
MestQ07646 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
MestQ07646 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
MestQ07646 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
MestQ07646 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
MestQ07646 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
MestQ07646 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
MestQ07646 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
MestQ07646 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
MestQ07646 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
MestQ07646 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
MestQ07646 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
MestQ07646 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
MestQ07646 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
MestQ07646 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
MestQ07646 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
MestQ07646 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
MestQ07646 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
MestQ07646 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
MestQ07646 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
MestQ07646 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
MestQ07646 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
MestQ07646 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
MestQ07646 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
MestQ07646 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
MestQ07646 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
MestQ07646 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
MestQ07646 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
MestQ07646 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
MestQ07646 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
MestQ07646 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MestQ07646 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MestQ07646 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MestQ07646 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MestQ07646 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
MestQ07646 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
MestQ07646 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MestQ07646 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MestQ07646 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MestQ07646 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MestQ07646 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MestQ07646 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MestQ07646 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MestQ07646 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
MestQ07646 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MestQ07646 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
MestQ07646 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
MestQ07646 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
MestQ07646 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
MestQ07646 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
MestQ07646 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
MestQ07646 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
MestQ07646 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
MestQ07646 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
MestQ07646 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
MestQ07646 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
MestQ07646 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
MestQ07646 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
MestQ07646 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
MestQ07646 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MestQ07646 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MestQ07646 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MestQ07646 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MestQ07646 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MestQ07646 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MestQ07646 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
MestQ07646 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MestQ07646 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MestQ07646 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
MestQ07646 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
MestQ07646 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms